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新证据!基因融合是乳腺癌的常见驱动因素
恒特基因首席科学家郑宗立博士有一篇关于乳腺癌基因融合的文章,发表在2017年12月《Cancer Discovery》(IF=19.78)上。这一题为:“Expressed gene fusions as frequent drivers of poor outcomes in hormone receptor positive breast cancer.”的研究,阐明了基因融合变异同样也是是激素受体阳性乳腺癌的常见驱动因素。
使用二代测序(NGS)的方法对RNA进行测序来检测基因重排,而不需要预先知道基因融合伙伴。通过对173名未经过筛选的具有高级别激素受体阳性(HR+)的乳腺癌患者进行检测,发现了14%的患者(24/173)带有包括PIK3CA, AKT3, RAF1和ESR1等驱动基因在内的基因间融合变异。并使用相应的荧光原位杂交技术(FISH)同时对原发癌症组织和转移病灶组织中进行了验证,确证了NGS的结果。
这一研究发现的激素受体阳性的乳腺癌患者中存在的融合基因变异类型
这项研究揭示了在高级别的激素受体阳性(HR+)乳腺癌患者中,发生包括关键的癌症相关基因在内的基因间融合的变异是非常普遍的现象。这些基因组的变化直接导致了相关癌症的病理生理学的改变。
研究证明了,多种新型融合蛋白产物能够激活和解除激酶的限制调控,从而在乳房上皮模型中产生癌变的现象。这些融合变异还能够使得依赖激素表达的乳腺癌细胞不再依赖激素就能够的增殖和转移。检测到的最普遍的融合基因产物都包含了ESR1,这一发现支持了它们与HR+乳腺癌发病机理的相关性。
这项研究同时还发现,携带有融合基因变异的肿瘤比基因融合呈阴性有明显更快的进展速度和更短的生存期,即融合基因变异的患者的预后可能更差。基因重排阳性患者的总生存期(OS)要明显短于基因重排阴性患者的总生存期(OS)。在300例原发性HR+乳腺癌患者中,融合是较为少见的(小于5%)。
总的来说,这一研究结果表明,在HR+乳腺癌中,基因融合是一种常见的、潜在的驱动因素。
在HR+的乳腺癌患者中,有基因重排阳性的患者比基因重排阴性的患者更快发生转移
在HR+的乳腺癌患者中,有基因重排阳性患者的肿瘤转移后的生存期,要明显短于基因重排阴性患者的肿瘤转移后的生存期
在HR+的乳腺癌患者中,有基因重排阳性患者的总生存期(OS),要明显短于基因重排阴性患者的总生存期(OS)
郑宗立博士是著名NGS专家,在美国麻省总院工作期间发明的"单端锚定多重PCR"(AMP)技术,目前已经得到广泛应用,尤其是在基因融合检测方面,有着独特的优势。目前,郑博士除了在香港城市大学任教之外,在恒特基因继续开发全新一代的专利NGS靶向建库技术——PANO-Seq®(已申请国际专利),这一全新的建库技术平台,可以让NGS在肿瘤的精准诊断和治疗应用方面更上一层楼。
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